寫在之前....
台灣海洋細菌的分類研究，相較於歐、美、日等先進國家是發展較晚的。公元1989年二月，末學恩師台大海洋研究所謝文陽教授自日本返國任教，才算是正式開啟台灣的相關研究。草創時期總是較艱辛的，不外是經費和分析工具的不足，這也是新穎菌種發表功虧一簣的主要原因。公元1998年，由末學與謝教授正式在期刊發表了台灣第一株代表新屬、新種的海洋細菌 Alterococcus agarolyticus，才算正式搭上了細菌分類的列車。公元2000年後，海洋細菌的研究跨入百家爭鳴的階段，也引發許多新國家的興趣，亞洲的中國與南韓有多組團隊投入這個領域，當然也成為我們的競爭的對手 (Why？此容我暫略)。這十多年來打了一場美好的戰役，實驗室發表了九個新屬的菌種，但隨著謝教授今年榮退，這數字相信再也不會增加了，這亦是末學想提筆記錄的原因之一。
Alterococcus agarolyticus 從那來的？
一九八O年代起，深海熱泉的菌種相繼被發現，這個主題儼然成為當時細菌界的顯學。台灣有没有能力做？没！没！没！....没工具、没經費、没經驗....那....有没有替代方案？ 啊....台灣有個綠島海濱鹹水溫泉(世界唯三)，剛好略沾上邊(當時龜山島地熱噴孔還没人理它！這個以後再來談！)。我們家老大(謝教授)洞察此情，就帶著鋼盔衝了，也就順理成了末學的研究重心了....
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西元1996年的溫泉區全景 |
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當年的帥哥研究生在採樣(頭上那一頂是俊國熊，但當時是象迷哦！) |
樣本取回後開始培養 (要培養來自溫泉的高溫菌當然要有一些秘技！)，發現會分解洋菜膠的菌株，這引起了末學極大興趣，於是將它純化分離，進一步要拆解它的一些生理、生化功能。
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經染色的洋菜膠培基，菌落位於透明凹陷處。 |
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電顯照 (它很難染色，這是比較好的照片！) |
該做的都做了！......就差16S rRNA基因定序！但没人做過！？
誰來教？ 感謝台大椰林風情BBS生物版的隠士，指引了明路，完成定序，並把系統樹畫好...
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Alterococcus agarolyticus 在演化上是極為特殊的一個分枝 |
下一步就是投稿！等待的日子總是難熬地....但難題又出現了！
回函：請做切片，做為判斷是革蘭氏陰性或陽性的證據。啊....我們不是染色了嗎？
Reviewer認為：球菌大多是陽性，請切片證明！ {哇哩咧...誰規定球菌一定是陽性。 海洋細菌(好鹽的哦)幾乎都是陰性啦！切片誰會啊.....？}
還好，朋友不少，就生出了照片....
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陰性菌的細胞壁 (紀念友人湯致遠) |
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光學顯微鏡下的球菌 |
總結：
Alterococcus agarolyticus
- Verrucomicrobia
- Gram-negative Cocci
- Motile
- Facultatively anaerobic
- Slightly Thermophilic (38-58°C, optimum 48°C)
- Slightly Halophilic (1-3% NaCl )
- Agarolytic
- CJM 1998
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遺珠之憾！ (具有脫氮能力的高溫細菌，達65度以上，但未能發表....) |
西元1988年CJM刊出了Alterococcus agarolyticus ，也成為台灣第一株正式學術發表新屬新種的海洋細菌。但...緊接著末學也去數饅頭了！(待續...)
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